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おおまかなストーリーの流れ。
あまり詳しくはありませんが、攻略の参考にどうぞ。

マークの意味 ：
[PT加入] ・・・仲間加入 / [PT離脱] ・・・仲間離脱 / [重要アイテム] ・・・重要アイテム
（1）はぐれた仲間の捜索 → （2）惑星エディフィスの謎
【28】学術都市ノット
リヴァルへ依頼完了を報告
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古代文明滅亡の理由に関する話
古代文明は、巨大津波によって一夜にして滅び去ったらしい。
問題は、津波の原因だが…。
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エディフィスの歴史を調べることに
[PT加入] リヴァル（戦闘には加えられない）
リヴァルが仲間になった後、宇宙船で3つの希少アイテムが入手可能になる。
うち1つはリヴァルとのイベントなので、ラングに出発する前に戻った方が良いかも。
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【29】ノットへの道
【30】スクリーム
【31】スネルペンテス遺跡
歴史を記憶している町ラングを目指す
単なる通過点で、特に何かイベントが起こったりはしない。
通過することだけを考えてもいいし、気が向いたら宝箱を回収しても良いと思う。
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【32】ラング
最高司祭ジーマから重要な情報を得る
[PT離脱] リヴァル
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クロードとレナの宇宙船墜落
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エディフィアン・ロセの話
[重要アイテム] アクアラング
[重要アイテム] メモリーチップ132
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【33】水没遺跡コムサ
エディフィアンの町アクアへ
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 [重要アイテム] ミンシディア
クロード＆レナを仲間にする（1/5）
コムサ遺跡海底の宝箱で幻の薬草「ミンシディア」が手に入る。
クロードを仲間にするために必要なので、後で戻らなくて済むようアクアに向かうついでに回収しておくと楽かもしれない。
（※クロードとレナを仲間にする一連のイベントは、ストーリーの本筋の中に組み込まれていない。仲間にしなくてもクリアできるかも？）
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【34】アクア
リーダー・ヴァイの話
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クロード＆レナを仲間にする（2/5）
ヴァイの部屋の前にいるエディフィアンと話すと、クロードたちが墜落した場所について情報を聞ける。ヴァイの話を聞いた後で探しに行こう。
2人のエディフィアンの試練へ
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クロード・レナを回収する場合はちょっと寄り道
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【--】ヌサビーチ
[PT加入] レナ
クロード＆レナを仲間にする（3/5）
バニスシティから出てすぐの場所でレナと再会し、クロードが病気になっている事を知らされる。
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【--】学術都市ノット
クロード＆レナを仲間にする（4/5）
研究所にいる薬剤師に「ミンシディア」を持っている状態で話しかけると、クロードの病気の特効薬を作ってもらえる。
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【--】バニスシティ
[PT加入] クロード
クロード＆レナを仲間にする（5/5）
特効薬入手後、バニスシティ入り口の民家前の男と話す。
これでクロード・レナを仲間にするイベント全て完了。
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【35】アクス
ラウムに助力を頼む
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移動要塞グランド・ノット起動
（アバシティへ向かう）
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【36】アスール
ネロに助力を頼む
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グランド・ノットの攻撃によってアバシティが壊滅
アクスとアスールは、どちらが先でも良い。
1つ目の試練が終わったところでグランド・ノットが起動し、2つ目の試練が終わったところでアバシティが攻撃を受ける。
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【37】レヴィアボア遺跡
10の封印を集めて移動要塞グランド・ノットへ
「封印」を入手するためには、同じ属性の「導き」が必要。
各階で1組ずつ導きと封印が手に入る。
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【38】グランド・ノット
要塞を操る者との戦闘
この時は、4階までしか入れない。
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グランド・ノット移動
エクス・トロキアへ
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【39】エクス・トロキア
【40】コロニー群
【41】コスモシティ入り口
グランド・ノットが停泊している最上階を目指す
最上階へは、エクス・トロキア→コロニー「コンセンス・デイ」→コロニー「ノルン」→コロニー「グラン・メトル」→コスモシティ入り口の順に通っていく。
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【40】コスモシティ
連絡通路からグランド・ノットへ
コスモシティはストーリー最後の町。
店で買える中では最も強い武器・防具や、他の町にはないクリエイト用品を売っているので、ラストダンジョンに挑戦する前に買い物をしておいても良いかもしれない。
なお、特にイベントはない。用がなければ素通りOK。
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【41】グランド・ノット
グランド・ノット中核へ
1回目では行けなかった5階以上のフロアにも入れるようになっている。
5階入り口の人物（？）からヒントを聞くと、比較的簡単。
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【42】グランド・ノット中核
＜最奥部に？？？が…＞
最後の決戦へ！
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